Con esta prueba valoramos el correcto alineamiento de los ojos, tanto de lejos como de cerca. Un desajuste en este alineamiento puede provocar molestias oculares tales como dolores de cabeza o cansancio. Realizaremos los dos tipos de cover test: alternante y unilateral. Con el alternante buscamos detectar la foria, un tipo de desviación que no se manifiesta salvo si se somete a los ojos a un estímulo visual. Con el unilateral el objetivo es detectar la tropia (estrabismo), que es un tipo de desviación manifiesta que impide la fusión de las imágenes.